Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK2

Rp2, Protein XRP2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp2Q9EPK2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rp2Q9EPK2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rp2Q9EPK2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rp2Q9EPK2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rp2Q9EPK2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rp2Q9EPK2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rp2Q9EPK2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rp2Q9EPK2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rp2Q9EPK2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rp2Q9EPK2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms