Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Syde1Q9DBZ9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Syde1Q9DBZ9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms