Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cbx6Q9DBY5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cbx6Q9DBY5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms