Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY0

Foxp4, Forkhead box protein P4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxp4Q9DBY0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Foxp4Q9DBY0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Foxp4Q9DBY0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Foxp4Q9DBY0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Foxp4Q9DBY0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Foxp4Q9DBY0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Foxp4Q9DBY0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Foxp4Q9DBY0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Foxp4Q9DBY0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Foxp4Q9DBY0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Foxp4Q9DBY0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Foxp4Q9DBY0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Foxp4Q9DBY0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Foxp4Q9DBY0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Foxp4Q9DBY0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Foxp4Q9DBY0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Foxp4Q9DBY0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Foxp4Q9DBY0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Foxp4Q9DBY0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Foxp4Q9DBY0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Foxp4Q9DBY0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Foxp4Q9DBY0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Foxp4Q9DBY0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Foxp4Q9DBY0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Foxp4Q9DBY0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Foxp4Q9DBY0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Foxp4Q9DBY0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Foxp4Q9DBY0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Foxp4Q9DBY0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Foxp4Q9DBY0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Foxp4Q9DBY0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Foxp4Q9DBY0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Foxp4Q9DBY0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Foxp4Q9DBY0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Foxp4Q9DBY0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Foxp4Q9DBY0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Foxp4Q9DBY0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Foxp4Q9DBY0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Foxp4Q9DBY0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Foxp4Q9DBY0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Foxp4Q9DBY0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Foxp4Q9DBY0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Foxp4Q9DBY0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Foxp4Q9DBY0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Foxp4Q9DBY0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Foxp4Q9DBY0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Foxp4Q9DBY0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms