Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Swt1Q9DBQ9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Swt1Q9DBQ9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Swt1Q9DBQ9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Swt1Q9DBQ9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Swt1Q9DBQ9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Swt1Q9DBQ9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Swt1Q9DBQ9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Swt1Q9DBQ9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Swt1Q9DBQ9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Swt1Q9DBQ9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Swt1Q9DBQ9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Swt1Q9DBQ9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Swt1Q9DBQ9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Swt1Q9DBQ9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Swt1Q9DBQ9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Swt1Q9DBQ9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Swt1Q9DBQ9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Swt1Q9DBQ9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Swt1Q9DBQ9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Swt1Q9DBQ9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Swt1Q9DBQ9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Swt1Q9DBQ9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Swt1Q9DBQ9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Swt1Q9DBQ9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Swt1Q9DBQ9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Swt1Q9DBQ9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Swt1Q9DBQ9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Swt1Q9DBQ9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Swt1Q9DBQ9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Swt1Q9DBQ9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms