Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SrpraQ9DBG7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SrpraQ9DBG7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SrpraQ9DBG7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms