Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp27a1Q9DBG1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp27a1Q9DBG1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms