Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBA6

Tysnd1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tysnd1Q9DBA6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tysnd1Q9DBA6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tysnd1Q9DBA6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms