Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Fundc1Q9DB70 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Fundc1Q9DB70 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms