Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL3

Ccdc54, Coiled-coil domain-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc54Q9DAL3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc54Q9DAL3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc54Q9DAL3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms