Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smim23Q9DAL0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim23Q9DAL0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms