Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc89Q9DA73 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc89Q9DA73 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc89Q9DA73 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms