Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ift43Q9DA69 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ift43Q9DA69 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ift43Q9DA69 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ift43Q9DA69 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ift43Q9DA69 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ift43Q9DA69 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ift43Q9DA69 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ift43Q9DA69 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ift43Q9DA69 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ift43Q9DA69 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ift43Q9DA69 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ift43Q9DA69 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ift43Q9DA69 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ift43Q9DA69 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ift43Q9DA69 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ift43Q9DA69 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ift43Q9DA69 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ift43Q9DA69 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ift43Q9DA69 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ift43Q9DA69 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ift43Q9DA69 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ift43Q9DA69 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ift43Q9DA69 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ift43Q9DA69 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ift43Q9DA69 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ift43Q9DA69 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ift43Q9DA69 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ift43Q9DA69 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ift43Q9DA69 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ift43Q9DA69 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ift43Q9DA69 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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