Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9DA42 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9DA42 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9DA42 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9DA42 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9DA42 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Q9DA42 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9DA42 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9DA42 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9DA42 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9DA42 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9DA42 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9DA42 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9DA42 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9DA42 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Q9DA42 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9DA42 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9DA42 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9DA42 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9DA42 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9DA42 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9DA42 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9DA42 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9DA42 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9DA42 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9DA42 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9DA42 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9DA42 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9DA42 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9DA42 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9DA42 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Q9DA42 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9DA42 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9DA42 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9DA42 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9DA42 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9DA42 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9DA42 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9DA42 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9DA42 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9DA42 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9DA42 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9DA42 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9DA42 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9DA42 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9DA42 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9DA42 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Q9DA42 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9DA42 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9DA42 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9DA42 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9DA42 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9DA42 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Q9DA42 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9DA42 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9DA42 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9DA42 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Q9DA42 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9DA42 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9DA42 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9DA42 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9DA42 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9DA42 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9DA42 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9DA42 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9DA42 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9DA42 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9DA42 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9DA42 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9DA42 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Q9DA42 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9DA42 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9DA42 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9DA42 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9DA42 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9DA42 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9DA42 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9DA42 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9DA42 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9DA42 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9DA42 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9DA42 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9DA42 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9DA42 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9DA42 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9DA42 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9DA42 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9DA42 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9DA42 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9DA42 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Q9DA42 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9DA42 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9DA42 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9DA42 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9DA42 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9DA42 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9DA42 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9DA42 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9DA42 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Q9DA42 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms