Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Samd8Q9DA37 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms