Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smco2Q9DA21 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smco2Q9DA21 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms