Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9T8

Efhc1, EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc1Q9D9T8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efhc1Q9D9T8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Efhc1Q9D9T8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhc1Q9D9T8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhc1Q9D9T8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhc1Q9D9T8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhc1Q9D9T8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhc1Q9D9T8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhc1Q9D9T8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhc1Q9D9T8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhc1Q9D9T8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhc1Q9D9T8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhc1Q9D9T8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhc1Q9D9T8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhc1Q9D9T8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhc1Q9D9T8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhc1Q9D9T8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhc1Q9D9T8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhc1Q9D9T8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhc1Q9D9T8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhc1Q9D9T8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efhc1Q9D9T8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efhc1Q9D9T8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efhc1Q9D9T8 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efhc1Q9D9T8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efhc1Q9D9T8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efhc1Q9D9T8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efhc1Q9D9T8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Efhc1Q9D9T8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms