Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9S1

UPF0193 protein EVG1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9S1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D9S1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D9S1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D9S1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q9D9S1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9D9S1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9D9S1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D9S1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9D9S1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9D9S1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms