Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cldn34b2Q9D9N2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cldn34b2Q9D9N2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cldn34b2Q9D9N2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn34b2Q9D9N2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn34b2Q9D9N2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn34b2Q9D9N2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn34b2Q9D9N2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn34b2Q9D9N2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn34b2Q9D9N2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn34b2Q9D9N2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cldn34b2Q9D9N2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34b2Q9D9N2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34b2Q9D9N2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34b2Q9D9N2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34b2Q9D9N2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34b2Q9D9N2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34b2Q9D9N2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34b2Q9D9N2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34b2Q9D9N2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34b2Q9D9N2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34b2Q9D9N2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34b2Q9D9N2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34b2Q9D9N2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34b2Q9D9N2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34b2Q9D9N2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34b2Q9D9N2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn34b2Q9D9N2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn34b2Q9D9N2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn34b2Q9D9N2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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