Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H3

Mbd3l1, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l1Q9D9H3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd3l1Q9D9H3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd3l1Q9D9H3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd3l1Q9D9H3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd3l1Q9D9H3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mbd3l1Q9D9H3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mbd3l1Q9D9H3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mbd3l1Q9D9H3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms