Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atg7Q9D906 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atg7Q9D906 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atg7Q9D906 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atg7Q9D906 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atg7Q9D906 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atg7Q9D906 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Atg7Q9D906 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atg7Q9D906 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atg7Q9D906 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atg7Q9D906 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atg7Q9D906 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atg7Q9D906 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atg7Q9D906 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atg7Q9D906 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg7Q9D906 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg7Q9D906 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg7Q9D906 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg7Q9D906 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg7Q9D906 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg7Q9D906 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atg7Q9D906 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.5 ms