Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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