Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ifi35Q9D8C4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ifi35Q9D8C4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ifi35Q9D8C4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ifi35Q9D8C4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ifi35Q9D8C4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ifi35Q9D8C4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ifi35Q9D8C4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ifi35Q9D8C4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ifi35Q9D8C4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ifi35Q9D8C4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ifi35Q9D8C4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ifi35Q9D8C4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ifi35Q9D8C4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ifi35Q9D8C4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ifi35Q9D8C4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ifi35Q9D8C4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ifi35Q9D8C4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ifi35Q9D8C4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ifi35Q9D8C4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms