Protein–RNA interactions for Protein: Q9D898

Arpc5l, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc5lQ9D898 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arpc5lQ9D898 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arpc5lQ9D898 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arpc5lQ9D898 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arpc5lQ9D898 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arpc5lQ9D898 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arpc5lQ9D898 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arpc5lQ9D898 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arpc5lQ9D898 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arpc5lQ9D898 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arpc5lQ9D898 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arpc5lQ9D898 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arpc5lQ9D898 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arpc5lQ9D898 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arpc5lQ9D898 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arpc5lQ9D898 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arpc5lQ9D898 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arpc5lQ9D898 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arpc5lQ9D898 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arpc5lQ9D898 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arpc5lQ9D898 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arpc5lQ9D898 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arpc5lQ9D898 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arpc5lQ9D898 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arpc5lQ9D898 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Arpc5lQ9D898 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Arpc5lQ9D898 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms