Protein–RNA interactions for Protein: Q9D883

U2af1, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1Q9D883 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
U2af1Q9D883 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
U2af1Q9D883 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms