Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem54Q9D7S1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem54Q9D7S1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms