Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmigd1Q9D7L8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmigd1Q9D7L8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms