Protein–RNA interactions for Protein: Q9D753

Exosc8, Exosome complex component RRP43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc8Q9D753 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Exosc8Q9D753 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Exosc8Q9D753 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Exosc8Q9D753 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Exosc8Q9D753 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Exosc8Q9D753 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Exosc8Q9D753 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Exosc8Q9D753 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Exosc8Q9D753 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Exosc8Q9D753 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Exosc8Q9D753 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exosc8Q9D753 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exosc8Q9D753 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exosc8Q9D753 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exosc8Q9D753 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exosc8Q9D753 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exosc8Q9D753 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exosc8Q9D753 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exosc8Q9D753 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exosc8Q9D753 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exosc8Q9D753 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exosc8Q9D753 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exosc8Q9D753 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exosc8Q9D753 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exosc8Q9D753 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Exosc8Q9D753 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exosc8Q9D753 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exosc8Q9D753 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exosc8Q9D753 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exosc8Q9D753 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exosc8Q9D753 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exosc8Q9D753 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exosc8Q9D753 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exosc8Q9D753 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Exosc8Q9D753 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Exosc8Q9D753 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exosc8Q9D753 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exosc8Q9D753 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exosc8Q9D753 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exosc8Q9D753 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Exosc8Q9D753 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms