Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y4

Borcs8, BLOC-1-related complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs8Q9D6Y4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Borcs8Q9D6Y4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Borcs8Q9D6Y4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs8Q9D6Y4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs8Q9D6Y4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs8Q9D6Y4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs8Q9D6Y4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs8Q9D6Y4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs8Q9D6Y4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs8Q9D6Y4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs8Q9D6Y4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs8Q9D6Y4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs8Q9D6Y4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs8Q9D6Y4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs8Q9D6Y4 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs8Q9D6Y4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs8Q9D6Y4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs8Q9D6Y4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs8Q9D6Y4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs8Q9D6Y4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs8Q9D6Y4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs8Q9D6Y4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Borcs8Q9D6Y4 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
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