Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6X5

Slc52a3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a3Q9D6X5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc52a3Q9D6X5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc52a3Q9D6X5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc52a3Q9D6X5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc52a3Q9D6X5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc52a3Q9D6X5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc52a3Q9D6X5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Slc52a3Q9D6X5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc52a3Q9D6X5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms