Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

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Length 129 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pfn4Q9D6I3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfn4Q9D6I3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfn4Q9D6I3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfn4Q9D6I3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfn4Q9D6I3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfn4Q9D6I3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfn4Q9D6I3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfn4Q9D6I3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfn4Q9D6I3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfn4Q9D6I3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfn4Q9D6I3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfn4Q9D6I3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfn4Q9D6I3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfn4Q9D6I3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfn4Q9D6I3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfn4Q9D6I3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfn4Q9D6I3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfn4Q9D6I3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfn4Q9D6I3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfn4Q9D6I3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pfn4Q9D6I3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfn4Q9D6I3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfn4Q9D6I3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfn4Q9D6I3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfn4Q9D6I3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfn4Q9D6I3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfn4Q9D6I3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfn4Q9D6I3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfn4Q9D6I3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfn4Q9D6I3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfn4Q9D6I3 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfn4Q9D6I3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfn4Q9D6I3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfn4Q9D6I3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfn4Q9D6I3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfn4Q9D6I3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfn4Q9D6I3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfn4Q9D6I3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfn4Q9D6I3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfn4Q9D6I3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfn4Q9D6I3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pfn4Q9D6I3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms