Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G3

2900055J20Rik, RIKEN cDNA 2900055J20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2900055J20RikQ9D6G3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
2900055J20RikQ9D6G3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
2900055J20RikQ9D6G3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms