Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PudpQ9D5U5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PudpQ9D5U5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms