Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lpcat2bQ9D5U0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lpcat2bQ9D5U0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms