Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5L7

Spsb1, SPRY domain-containing SOCS box protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb1Q9D5L7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Spsb1Q9D5L7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Spsb1Q9D5L7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms