Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
H2al3Q9D4U4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
H2al3Q9D4U4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms