Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K4

Fancd2os, FANCD2 opposite strand protein, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fancd2osQ9D4K4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fancd2osQ9D4K4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fancd2osQ9D4K4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms