Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Phf6Q9D4J7 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Phf6Q9D4J7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms