Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Lonrf3Q9D4H7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lonrf3Q9D4H7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms