Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gcc1Q9D4H2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gcc1Q9D4H2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gcc1Q9D4H2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms