Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4B1

Sgms2, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sgms2Q9D4B1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Sgms2Q9D4B1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Sgms2Q9D4B1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Sgms2Q9D4B1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Sgms2Q9D4B1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Sgms2Q9D4B1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Sgms2Q9D4B1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Sgms2Q9D4B1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Sgms2Q9D4B1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sgms2Q9D4B1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Sgms2Q9D4B1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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Sgms2Q9D4B1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Sgms2Q9D4B1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Sgms2Q9D4B1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Sgms2Q9D4B1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sgms2Q9D4B1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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