Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syce1Q9D495 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syce1Q9D495 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms