Protein–RNA interactions for Protein: Q9D489

Sohlh2, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh2Q9D489 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sohlh2Q9D489 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sohlh2Q9D489 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms