Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933428M09RikQ9D3X3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms