Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rsph14Q9D3W1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rsph14Q9D3W1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms