Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mrpl28Q9D1B9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms