Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Syf2Q9D198 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Syf2Q9D198 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms