Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tmem53Q9D0Z3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem53Q9D0Z3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms