Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hdhd3Q9CYW4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hdhd3Q9CYW4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms