Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ssu72Q9CY97 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssu72Q9CY97 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssu72Q9CY97 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssu72Q9CY97 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssu72Q9CY97 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssu72Q9CY97 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssu72Q9CY97 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssu72Q9CY97 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssu72Q9CY97 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssu72Q9CY97 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssu72Q9CY97 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssu72Q9CY97 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssu72Q9CY97 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ssu72Q9CY97 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ssu72Q9CY97 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ssu72Q9CY97 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ssu72Q9CY97 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ssu72Q9CY97 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ssu72Q9CY97 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ssu72Q9CY97 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ssu72Q9CY97 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ssu72Q9CY97 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ssu72Q9CY97 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ssu72Q9CY97 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ssu72Q9CY97 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ssu72Q9CY97 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ssu72Q9CY97 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ssu72Q9CY97 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ssu72Q9CY97 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ssu72Q9CY97 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ssu72Q9CY97 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ssu72Q9CY97 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ssu72Q9CY97 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ssu72Q9CY97 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ssu72Q9CY97 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ssu72Q9CY97 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ssu72Q9CY97 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ssu72Q9CY97 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ssu72Q9CY97 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ssu72Q9CY97 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ssu72Q9CY97 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ssu72Q9CY97 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ssu72Q9CY97 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ssu72Q9CY97 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ssu72Q9CY97 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ssu72Q9CY97 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ssu72Q9CY97 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ssu72Q9CY97 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ssu72Q9CY97 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ssu72Q9CY97 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms